Joidenkin esi-isieni alkuperä ei näy selvästi esiintyvän esi-isyyden tuloksissani.
Tämä voi tapahtua, jos tuloksissasi ei näy joidenkin esi-isien esi-isyyttä. Tämä ilmenee erityisesti silloin, kun kyseinen esi-isä on useiden sukupolvien takana. Näiden esi-isien väestöt häviävät ajan myötä, jolloin säilyvät vain ne, jotka ovat hallitsevampia ja tuoreempia sukupuussasi.
Lisäksi eri väestöjen geneettinen koostumus voi vaihdella ajan mittaan historiallisten tapahtumien, muuttoliikkeiden ja sisäisten dynamiikkojen vuoksi. Siksi esi-isiäsi edustavan väestön geneettinen konteksti voi poiketa hieman sen väestön nykyisestä geneettisestä kontekstista. Etnisen alueen esi-isällä voi olla erilaisia geneettisiä merkkiaineita kuin niillä yksilöillä, joita käytetään viitteenä kyseiselle väestölle.